树坑石中有些成分容易与外界环境发生作用，使石材产生侵蚀或变异现象。树坑石一般都不同程度地含有铁的成分，受到潮气的侵蚀会产生锈黄。树坑石石材中的含铁量越高，锈黄越容易产生。另外，大多数天然大理石的主要成份为碳酸盐，如碳酸钙和碳酸镁，还有少量的碱性氧化物。
    碳酸钙和碳酸镁是相对比较稳定的化合物，但某些碱性氧化物的化学性质不稳定，在潮湿的环境下，易与空气中的酸性氧化物如二氧化碳﹑二氧化硫﹑三氧化硫﹑二氧化氮等发生化学反应而改变大理石内部的物理结构。类似的化学破坏也会在其他石材上发生，轻者会使石材表面失去光泽，甚至颜色褪变，出现斑痕；重者会使天然石材硬度下降，表面风化剥落。